以“肝病”的治疗为例，西药的逻辑是研发出能够与谷丙转氨酶的分子结构相结合的分子结构，根据物质不灭定律，结合后一定会产生出新的分子结构，至于新的分子结构对身体有没有伤害，因为身体是个复杂的系统，无法计算，但是谷丙转氨酶的数据指定是降低了。
西医对于治疗效果的评估，就是到底是治好还是没有治好，评估的依据就是谷丙转氨酶、蛋白以及胆红素的数据指标是不是恢复正常。
西医诊断就是依据身体内，具体物质的数据变化，是不是超出规定的数值范围，治疗逻辑就是如何恢复到数值范围，采用对抗、打压的治疗方法。
手术、放化疗完全是对抗消灭的方式，西药逻辑是分子机构与疾病重要参考物质的分子机构合并，以达到参考物质的数值恢复到规定范围。
至于产生新的分子结构对身体有没有影响，不得而知，也正基于此，才使得通过严苛的双盲实验的西药，上市不久，因为发现具有引发其他疾病甚至后遗症，不得不下架的主要原因。
五：西医往往把指标看作是万能的，很多西医离开指标就看不了病，离了仪器就抓瞎了。从上可见，指标不正常，并不一定是有病或如指标所示的那么严重。反而没有被重视的却是在指标正常的情况下，人体却感觉异常。由此证明，指标不是万能的。比如，指标就查不出人的心情变化，查不出食欲是否减退，睡眠是否良好，就更加查不出头晕脑胀，疲倦乏力这类的“亚健康”状态了。其实往往这时，就已经到了该认真调整的时候了。一味地相信那些指标，还真不如相信自身的感觉来的科学。人体自身感觉之精密度及准确度恐怕不是什么仪器可以取代得了的。
在临床治疗中遇到过这样的例子太多太多了！在长期的临床实践中我也发现，很多患者经过医院的治疗，很多指标正常了，但患者越来越没精神了，感到病越来越重了。也有的患者经过中医治疗，身体感到舒服了，能吃能睡了，和正常人没有区别人，结果去医院检查，反而指标不正常了。
治过好些例严重的风湿病患者，他们刚治疗时大都行动困难，关节肿大疼痛，医院检查风湿因子高。经治疗一段时间后，患者关节肿大消失了，也不疼痛了，行动也轻松自如了，可是去医院一检查说风湿因子反而更高了，你说这是不是怪事？其实这个道理是可以解释的，因为患者没有治疗之前他的病主要表现在寒湿留于关节，血液中的风湿因子不多。但中医采用温化的方法，把关节处的寒湿温化了，于是这个寒湿就流了全身。关节处的寒湿温化之后，患者感到不肿大了，也不疼痛了。这就像一个冰块，这冰块没有融化之前，它的寒凉只局限于冰块本身，但它一旦融化了，冰水四流了，冰水所流之后，都是一片寒湿。因此这时候去检查，风湿因子那是肯定高了，但通过采用中医的治疗方法，把这些寒湿完全排出体外之后，过一段时间再去检查，风湿因子又正常了。我们要注意这个正常那是病灶排除之后的彻底正常，身体内病因没有了，病也就彻底好了，这就是中医的治本。
又比如有的乙肝患者，有的传染病患者经过一段时间的医院治疗之后，一检查，各项指标趋于正常，但病人却感到越来越难受，越来越感到不舒服。这是为什么呢？检查各项指标正常，按理说病应当好了，病好了，病人也应感到舒服了，而为什么病人却感到病越来越厉害呢？这个检查指标正常有没有意义呢？我百思不得其解。
但是前两天我读了著名中医大家陈慎吾的《金匮要略讲义》一书，里面有这样一句话“且有每遇传染病偏用寒凉，致病毒隐匿不透，每致并发症、后遗症迭见，预后极为不良，此吾辈极应注意者也。”这里陈老先生谆谆告诫，若偏用寒凉，会导致病毒隐匿不透，病毒隐匿所以一检查指标都正常了。可是这个正常是打压下的正常，是隐藏起来的正常，这个正常的表现之下却是暗流涌动！于是在这正常指标的掩盖下：胃炎治成了胃癌？鼻炎治成了鼻咽癌？肝炎治成了肝癌？胰腺炎治成了胰腺癌？乳腺增生治成了乳腺癌？前列腺炎治成了前列腺癌？肾炎治成了尿毒症……
举个例子，像风寒感冒类病往往会出现持续发热这一症状，中医认为此时是人体阳气或正气与外邪交战双方势均力敌时所表现的一种正常的免疫反应，这个时候应因势利导给予辛热发散类具有振奋人体阳气的药即可通过发汗等方式祛除外邪。
用输液或口服等其他方式让性属寒凉的抗生素进入身体，表面上看似体温降下来了实际上病因未除，实际上是将发热机制硬生生打压了下去，导致的恶果就是使外邪侵入人体更深层。据有关资料，经常输液的人会有脚踝水肿，易反复感冒，且感冒后常常绵延不愈，长期如此易生肿瘤等这类重症。