鲜鸡蛋放入冰箱前不需要清洗。鸡蛋表面天然存在一层保护膜，清洗会破坏这层屏障，增加细菌侵入风险。正确处理方式包括检查外壳完整性、冷藏保存、避免与其他食物直接接触、保持干燥环境、大头朝上放置。
鸡蛋外壳覆盖着称为角质层的天然保护膜，能有效阻隔沙门氏菌等微生物侵入。水洗会溶解这层蛋白质薄膜，使气孔暴露。实验数据显示，清洗后的鸡蛋在相同储存条件下菌落总数比未洗鸡蛋高 3 - 5 倍。
冰箱 4℃环境能抑制细菌繁殖，延长鸡蛋保鲜期至 4 - 5 周。储存时应放置于冷藏室中层隔架，温度波动小于冷冻区。研究证实，常温存放的鸡蛋一周后新鲜度下降速度是冷藏储存的 2.8 倍。
建议使用原装纸盒或密闭容器存放，避免与洋葱、生姜等气味强烈的食物接触。鸡蛋壳具有透气性，48 小时内可吸收周围食物中 60% 的挥发性气味分子。
潮湿环境易导致霉菌滋生，储存区域湿度应控制在 45%-55%。可在鸡蛋盒内放置食品级干燥剂，但需避免直接接触蛋壳。湿度超过 70% 时，鸡蛋变质风险增加 4 倍。
气室位于鸡蛋大头端，朝上放置能保持蛋黄居中，延缓气囊扩大速度。测试表明，正确放置的鸡蛋在储存 28 天后，蛋黄偏移度比倒置存放减少 67%。
日常食用前可用流动温水冲洗蛋壳，但需立即使用。选择鸡蛋时注意查看生产日期，冷藏保存的鸡蛋取出后应在 2 小时内烹调。打蛋时使用单独容器，避免碎壳污染蛋液。老年人、孕妇等特殊人群建议食用全熟蛋，蛋黄完全凝固可杀灭 99% 的致病菌。每周鸡蛋摄入量控制在 3 - 6 个为宜，搭配深色蔬菜食用能提高铁元素吸收率。若发现蛋清浑浊、散黄或有异味应立即丢弃。
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