盒装豆腐的保质期一般为 3 - 7 天，具体时间受到包装方式、储存条件、是否开封、添加剂含量以及生产工艺等多种因素的影响。
真空包装的盒装豆腐因隔绝氧气可延长保质期至 7 天左右，普通塑料盒包装通常为 3 - 5 天。部分采用充氮保鲜技术的产品保质期可达 10 天，但开封后仍需尽快食用。
未开封的盒装豆腐需全程冷藏于 0 -4℃环境，温度波动会导致微生物加速繁殖。若储存温度超过 6℃，保质期可能缩短一半以上。购买后应避免长时间置于常温环境。
开封后的豆腐保质期急剧缩短至 24 小时内，因接触空气和器具会引入杂菌。建议将剩余豆腐浸没于煮沸冷却的盐水中，更换容器密封冷藏，可延长至 48 小时。
含防腐剂的灭菌豆腐保质期可达 15 天，但天然制作的卤水豆腐通常仅 3 天。部分采用巴氏杀菌的盒装豆腐未添加防腐剂，保质期约 5 天，需特别注意包装标注的工艺类型。
超高温瞬时灭菌处理的豆腐保质期较长，传统点浆工艺的豆腐易变质。部分品牌采用无菌灌装技术，未开封时保质期可达 20 天，但口感会偏硬，适合长途运输。
建议购买时选择生产日期较近的产品，开封后观察豆腐表面是否发黏、出现酸味或霉斑。可将豆腐用于高温烹调的菜肴如麻婆豆腐、豆腐煲等，充分加热能降低微生物风险。日常可将豆腐分装冷冻保存，但解冻后质地会变粗糙，适合炖煮类料理。注意与其他生鲜食品分开存放，避免交叉污染。
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