香菇蘑菇清洗可采用流水冲洗、盐水浸泡、淀粉吸附、软毛刷轻刷、快速焯水五种方法，既能有效去除泥沙杂质又避免营养流失。
将香菇菌盖朝下置于流动清水下，用手指轻轻搓洗菌褶部位。水流压力不宜过大，避免破坏菌肉结构。重点冲洗菌柄与菌盖连接处，该部位易藏匿虫卵。冲洗时间控制在 30 秒内，洗净后立即用厨房纸吸干表面水分。
用 3% 浓度盐水浸泡 5 分钟，盐分渗透作用可使菌褶中杂质脱落。每 500 克蘑菇配比 15 克食盐与 1 升清水，浸泡时轻微搅动帮助泥沙沉淀。该方法对表面粘液较多的平菇效果显著，但浸泡后需用清水二次冲洗避免咸味残留。
干香菇复水时加入 1 勺马铃薯淀粉，淀粉分子能吸附褶皱中的微小颗粒。水温保持 40℃左右，浸泡 20 分钟后淀粉水会形成浑浊悬浮液，倒掉后换清水漂洗两次。此方法特别适合处理花菇等菌褶密集的品种。
选用牙刷大小的软毛刷，沿菌盖纹理单向轻刷。对于牛肝菌等表面多凹凸的品种，可配合低压水流边冲边刷。注意避开菌柄与菌盖连接处的脆弱部位，刷洗力度以不破坏表皮蜡质层为度。
水沸后放入蘑菇焯烫 10 秒，高温使菌体收缩排出内部杂质。500 毫升水中可加 5 毫升白醋增强清洁效果，焯后立即过冷水保持脆嫩。该方法适用于即将烹饪的情况，能同步去除草酸和部分嘌呤物质。
清洗后的蘑菇应沥干水分冷藏保存，建议 24 小时内食用完毕。搭配富含维生素 C 的彩椒或绿叶菜烹饪，可促进铁元素吸收。日常储存时避免使用密封袋，改用透气纸袋包装防止冷凝水滋生细菌。对于野外采摘的野生菌类，务必确认品种安全性后再采用上述方法处理。
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